报告题目:冷冻电镜单颗粒技术数据处理流程及结构分析
时间:8月9日9:00
地点:冷冻电镜中心一楼会议室
个人简介
刘聪聪,深圳国家感染性疾病临床医学研究中心,助理研究员。2014-2019年就读于北京大学基础医学院,获生物物理学博士学位;2019-2021年在深圳市第三人民医院完成博士后训练。2021年至今,在深圳国家感染性疾病临床医学研究中心任助理研究员。主要研究方向为利用冷冻电子显微学、生物化学及分子生物学等多学科实验技术手段研究病毒或生物大分子复合物的工作机制。主持国家自然科学青年基金,深圳市科创委面上项目。相关研究成果以第一作者(共同)在Cell, Nature Communications, PNAS, Cell Reports, Journal of Virology, The Journal of Immunology等期刊发表。
内容简介
冷冻电镜单颗粒分析技术,是利用冷冻电镜解析结构的重要技术之一。需要在linux电脑操作系统下,需要用到RELION,CryoSPARC,IMOD,pyem等软件,熟悉Python,shell等编程语言。采用这些软件/编程语言,从冷冻电镜图片中挑选出目标颗粒,通过三维重构得到目标生物大分子的电子密度图。根据电子密度图,利用COOT,Phenix等软件,搭建出原子模型,并利用Chimera,Pymol等软件进行图片绘制,阐述生物学问题。